Bovbjerg Fyr er en selvejende institution med en fondsbestyrelse og et anpartselskab.
Fondsbestyrelsen har repræsentanter for Lemvig Kommune, Region Midtjylland, uddannelsesinstitutioner, natur- og fritidsinteresser, erhvervsinteresser, kulturinteresser og støtteforeningen.
Anpartselskab
Anpartselskabet står for fyrets aktiviteter. Direktionen består af Bo Larsen, Astrid Kaasgaard og fyrmoster Sara Bruun Buch
